Gene detail

Detailed information of PE_Scaf1392_0.3 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf1392_0.3	UNCHARACTERIZED HYPOTHALAMUS PROTEIN HT007	Superscaffold6	2175744	2180653	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

Transcript

PE_Scaf1392_0.3

ATGATCTCTTATGTGCTGTTTGACCAGGTAAATATGTACGGACAAATTGCTCACAATCGCCAATACGTTATTTGACCAGATACGGTCAAATAGCACTATGTCGTTATTTGGCCGGATACGGACTGATAGCTCATGATTGCGTATACACTGTTTGACCAGGTAAATATGCTATGCCAGCTTATTATGGCAAATATGCCGTTTGACCGGATAAATAAAAAAATTATTTACGTAAACATAGATCTAGTACCTTTAACAAACTAGTGCAAAACATTGCTTATTGACAATCTGTGACGTATCATAGTATTTGAAACAGCCTTGATTCAAATGCTTCAGATATATTATTTTGATTACATGTGTTTGTTATTTCGCAGGATTCTGGATTGCTAACAAAAATGAAAATGTTTTGTTTTCTCTTACACAATACAATGTAACTGTGCACTTGTTCGCTCGGTGTCGTAGAACTGTAAAATTTCTCTGTTGGAAATTGGTACCAGCTGCCGATAACGTTTCAAAATCCTCGAACCACCACCGCGTTCATCTCAGTTGTTCGAATCCAAGCTAACTTTGATCAGTGTTGCACAAGACATGACAGTGTACATTACTTCTAAAATGCTATCCATTACGCTCCTTGCAATTTTAACAGCAATTGTCATGCGAGGATTTAAAAAATTGGTGTAGATAATGAAGATTTAACGGAAATTTTTAAATTAAATTGATTACGAAGCATATACTATTGGGGATTGTTATTCTGTATATTAACTAAATGACTTTCTGATTGCAACATGATGACATTATTATGTAAAATAATTCACTATGAGCAGTGTTTGAACTTGCACCGGAAGATCCCATTGGATTTCAAGTCAAACGCCTTAACCATTTGGCTATCACAGCAGTTGTAGGACCCAATCTGCTCCTAACATAATAGATGAGATGTGCGAAAATGTGCACAATGATATAAAATTGCACAAGAAAATTTGTCCGGATAAATAGCCTATGTCGTGCCCTATGCTATTCGTCCGTACCGGAGGACGAATAGCCACTCCAAAAATATTAAGATGTGTCAATAAAGTTTCTAATGTAAGGAAAACAGTGTCCATTAAAACAGGCCAAGAAACCAGAATTTATGTAAATTCATAGGAGGTTCTTTTAAAGTTTGTTAGAGAATTGCCACCATTATATTGATCATATATATATATACCCAGTAGTTCTATAATTTCTCCAAAACGCAACACATACATGTCACTCTGTATTGACTAATAGCTGATAAATGTTACTAATTTGTTGATGATACTTTTTTGATGTTTGTTAGTTCTCCTTTGTGTTCACAGGGGGCGATGGAGGGCGAGTTGACGAAAAGTGTTCAGAAGTTTGCAGACGCAAGGAACATACCCAAGGGCGCTGTCATACTCACAGAAGATGAAGTGGAAAAGATGAAATGGAACATTGTAAACAAATGGAAGCCAAAGAGTGAAATGTGGGTGCAGTGCAATAAGGGAGTGACTAGTCATGATTTATCTGGTGGGTGGGTTGAGGAATAAAATGTGGGCTCAGTTGTCAGTACACAGGATTTCAGGGTGGGTCAGATTTCAATGTTGGAGATTTAGAGGTGGGTCCATTTAAAGGCACGATTCTGCCAACAATACTAATAATGTTTACCAATGAACAGAATTTCAGTGCATGATTCATGATGTTGAGTTGGAAATGAAGGTGTATTCTGCGATTCCTCTGCTAATCTCTCTTTTATACACACATAGCATAAATATTCTGGTTTGTTAATTGGATGCAATGTAGTCGATGCAGTTGTTCATTTAGCACAAATAGACACAATGATGCACAGTGTTTGTTTAAGTTTATTAAACCATAAAGGTGATGTTTAAACATCAGTAAGACCATTTATGCAAAACTATGCTAATATATAATGTAATAAGACCATTTATGCAAAATTATGCAAATACATAATGTAATAAGACCATTTGTGCAGAAGAGTATTAAGACATAACGTAACCAGTTTCCAATGGTAGCAGAACAAAGTTAGTAATTATTATACTTTTTGCACAACAGAAGTGTATATTGCAATAAGATGTAATTTACTGAATAAATGTGCATTTGAAATAAGATCTTTCTATTGACAGTGGTGAGATTTATTCATGATGGTTTCCTTCAATCCACTTACATCTCAGACACTTAACAGACACCAATGGCTCATATAAATTACATGACGTTTTTATGTGGATCTTTGTTTTCACAGATAGAACATTATTTTCATATACCTGCATCAAAATAAACTCATAAAGCCTAAACATTTGTCTGATCAGACAGATCTGAATCTGTTGAATTATAAATAAACTGACAAATATGAACGCTCTCTTTCAGGTGGTCACTGGCGTATGGCAACATTATCACGGGAGGCATCGCCACATTGTCTGGAGTACTGCTCAACTATCACTATCGGCAACAGTTCAAACTACGAACACTAGGTCGCTACATCTCGTACGCTCCAGTGGTTGTCATACCGTTTCTGACGACTGCAGTGTTCCAAGCTGTCCTGGTGACTCTACCAATAATGTCTGATCGCATCAACTGTCCTCTCTGTGCCGAGATACGTTCTGGCTGTTTGCAAACCCTCTTCGGCTTCGTGCAGCCGGTGTTGTTGTCAGCATTGGGGTGTACCGCACTCAGTAAGACTTTCCAAACCATAGCTATGCCCCCTGATTGGGCCGGCATGGCACAAATGCATGCGAGGATGCTACGACCAATCCATGTTCCCATCGCTGCTTTGTTTGGCCTCAACATCATTGCGGCGATGTGCATCACGCAGGAACAAGGGAAAATGTCTGTCAAGGTGACAAAGCGACTACAGGGACAGTTTAATGGCTAGACGTGATATGTGTTTGTGTGTGTGTTATGTTGTCACACCAATAAATAAGTGTAACACATTGAATTACATGTTTCTTTATGTAAGTACTTTATTTTTGTATATTGTTACGCTAGAGGGGGTGTTTTTGAGAACCCACATCTGATCAATTTTCAGTACCATCCTTCCAATTCCTGCCCGTCTTGCTGTGGCTGTAATGATATTGTGTAGCATTACTCTAGAGAGGGGGTGTGGCTGTAATGAGAGAGGGGGTGTGGCTGTGGTCTCGCCCTCCCATCTCCCAGTATTTTTCAGAATCCAAATCCGATCAATTTTCGGTACCAGCCTTCCACTTCCTGCTATAGCTAAAGTGACCTGATATATATTTAGTGGTATCAAAAATAGATAAGCGAGCCAAAAATGAACAACTTGAAACTCGTCCAAAACATGAAATTCTACGGTCGCTAGCAACCTCACGTCTCATCCGATCCCAACGATCTTAGTATCATTTGAAAGTATGCACTTTCTTTTATTCTAGCATCATCTAGATTACGGACCTACAATTATGCCGTTTTCAGTGTTCTGTAGGCCTATGCCTAACTATACTACTCTCATGATTGCACCAATACATCCTCGCAAGCTAGGGCTGTTTGCCATGCAAAACTAGCCCTGGCTGATCCCCTATGCGAAGTAGGCTGAGCTTAAATTCAGTTTCACAAAGCGATCAGCCAGGGGGTACTACTGGCTGGCACTGACGTAAACAGCAGCAGCAACCCCCTGGCGCGTGAGGATGGACCAATAGACTTCTTATTGAAGTTATACTCAAGTTTTTTGTTAGGCGTAAATGAATTTATAACATCGAGTAAAGGATGTATATACCTGGTAGAGAATATGTGAGGCTACAAATCCAAATGCAGGAAACTAAGAGTAAGAACAAGCAATATTTATTCAATGTTGCTAACTGCAGTGAACACACAACTTAAAGTTACAGAATCTGATTGTTTTGATCACAACTTAATTTGTTGCATTGTTAATGTGATGAAGCAGTGACAAAAATGTATTGTCATATATGTTATTTTTTGTAACACATGCTGCATTAAATATTACTACAGCCCACTGCATATGACTAATACCCTACGAGTACATCAAAAATATCCACATAAAAACATTCTACACATTATTAACATTTTCCTAATACTAAAAGCTGTAAAGAAAAATAGTTTCACATAAAAAATCGTTTGTATATACATATACAGGTCAACAGGGGTAGCTCTGCTGATAAATTATTGGTTTATTTTAAACATATTAAACCAAGCATAACTTCATAAAAAGTAAACTTCATAGCAACATGTTATTAACAAACAAGAGATGGTTTACATGGCGATAACAAATGAACTGCACATGTTAGATTTGATAATACTGAGAGACTCGGTAGCTTGGAGAAGTAGGGTCTTGATGCAGTAGCTCTAGTAGGGCGTCTGCAGGTATCACCGGGGCAAGTTTCTTCAGCCTTTCTGCCGTGTAATGTCTGTTCACAACTGCCTTACACATGTCCTTCAAGGTGTACACTGAAACACAAAACAAACAGTACTTCAAAATCATGTCAACCGTACTTTGCTTTAATTAAAGGCAGCTTACCATCACAATTCATAACACACATTCAAAGGAATAAATCAAAACAAAAACAGACGTATAAAACAGATACTATTGAGCAATGCTCGCAAAAAATGCGTGGTTGTGGCAAAGTAACATATCAAAAATAAATGTTGAATTTGTATGTTTTTAACTGTTACTATTAATGTAATGGTTCTAATGTACACATGGAACAGAAAAGCATAATCTGAACTATTAGTAAAAGTTTAATATATTCAGGGTTAAAGTATTAAATCTGACACATCTCTGGTAAAATAATGCTGGTAACAGTGAAGGTGCCAGAGTACTTTTGACCAGGATGACTTTTGACAGGTGGATGAGTGATGGGGATTTGGAAGTGGGTCAATAGTCAGTTTTCAGAATTTTGCAAACACTATTTTTTTTATACAAAATATGGTATCAG

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF07114	TMEM126	Transmembrane protein 126	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR009801	Family	Transmembrane protein 126	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR16296	UNCHARACTERIZED HYPOTHALAMUS PROTEIN HT007	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005739	Cellular Component	mitochondrion	Interproscan
GO:0032981	Biological Process	mitochondrial respiratory chain complex I assembly	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf1392_0.3 global RNA-seq network