Gene detail

Detailed information of Paelopatides19197 in Paelopatides sp. Yap Gene info

Gene ID	Annotation	Contig	Start	End	Strand
Paelopatides19197	AG-1 BLOOD STAGE MEMBRANE PROTEIN HOMOLOGUE	ctg38199	6917	14079	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

Paelopatides19197

ATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGATGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTATGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTATGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGATGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTATAGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGATGTGGTAAATGTGTTTGTGATCGGATCATGCTATATAAATGTGTTTGTGATGGATCATGATGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTAGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTGAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTAGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTATGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGATGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATTCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTGAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTAGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTAGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTAGTAAATGTGTCTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTCTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTTATAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTAGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTAGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGATGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTAGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTATGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTAGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTAGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTAAATGTGTTTGTGATGGATCATGCTGTGGTTTCTGAAGGGTTGGATTTCGCTGACATCAACGGCAGAGCGGTGATCATTACTGGGCTACCCTTCCCTCCCCAGATGGACCCGAAGGTTAAACTGAAGATGCAATATTTGGATGAAATTAGACGGAAGTGTAAGGTAATTATCAGTTCAAAACCTCTATATTAA

Transcript

Paelopatides19197

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF13307	Helicase_C_2	Helicase C-terminal domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR006555	Domain	ATP-dependent helicase, C-terminal	Interproscan
IPR027417	Homologous_superfamily	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase	Interproscan
IPR053336	Family	Rhoptry Surface-Associated Protein	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR37320	AG-1 BLOOD STAGE MEMBRANE PROTEIN HOMOLOGUE	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003676	Molecular Function	nucleic acid binding	Interproscan
GO:0004386	Molecular Function	helicase activity	Interproscan
GO:0005524	Molecular Function	ATP binding	Interproscan
GO:0006139	Biological Process	nucleobase-containing compound metabolic process	Interproscan
GO:0016818	Molecular Function	hydrolase activity, acting on acid anhydrides, in phosphorus-containing anhydrides	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-