Gene detail

Detailed information of ctg1058-0.3-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg1058-0.3-1	OS05G0565100 PROTEIN	chr3	14729642	14738446	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg1058-0.3-1

AGGGAACAGTTAATTTTGGAAACATTTGGTGCACGTTCATAATAAAATAGACATTTATTTATTGTGATTTGCACATGATATCCGATTCCGACAACCAGTCTGGGAAGACAGAATCAACATATCCAATCATTAGCTTCATTTCCAGGATGGTGGCACATTTTGTCTCAGTGTTATTCACAGCTTTTATTGTATATACCGCTCAACCTGGCTCCAATGGCACCGTTGTGTGGCGTTGTGCGACTAGAAATGCACAGGTCAAGCATTGTCGAGCATCGGTTAGACAGCAGGCTGACCTGTTTGTGGCTGGAGATGTCACTACTGGAAGAAAACGGTATTTGATCTTTTCAACAGATCAACAGCTGCAGCTGTTATCTAGATCCACGTGCTGGTACGCAGACAGTACCTTCAAGCTTGTGAAGGAACCGTTCACGCAGCTCTTTAGCGTACATTCTTTCATCAGGCATGAAGACTGTGCAAAACAGATACCACTTGTTTTCTGCCTGATGTCTGGACTTCGCAAAAAGGACTACAAGGCTGTTTTGGAGGCGATCATTGGGATGTTGCCCCAGGCACCGAGGATTCAAGACCTTGGTCTTCGTCAAGCCTACCTTAGTGACAACGACACTCACAGATATCTGAGGAAATTGATGTCATTGCCTTTTCTTCGACATCAACACATTCCAGCTGTGTTTGATGGGTTGAAGGCAGAAGCATCAACTGACCAGCTGACAACTTTAGTCGAATACCTGGAAGCGACCTGGATCCTGGATGCAACATGGACACCAGACAGCTGGAGCGTATACTTTCAGAGTATACGCATCAACAACGACGTTGAAGGATGGCATTTCAGACTTAACAACCGAGGTCGTCCCCAAGTCCAGCTCTACCTGCTTGTGTCCCTGCTGCACCAAGAAGCCATCCACATCAGCAACCAGGTTCGACTGGTGTCAGATGGAAAGTTGAAGCGGATGCAGAAGAAGAAGTACCGCGACATGCAGGCTAAGACATTCAAGTATTGGGAGGAGTACGAACGTGGCCTTTTTTCATGGCACCCTACACTGATGTCTATTGCTTTCCTGTGCCTACTGTTCGAAGGCATCCTGGTGTTTTCTCCTCAGAGCTCTCTCGTCTCCTCCCTGTCTCGCAAGGCGAAGCTCACCGCTCACTGGCTCTTTCAAGTGAGTGCTCTCACATTTGCCGTGTCTGGCTTCCTCGTGATCTGGTATAACAAACACCTCAACAACAGCAACCACTTCACAACGTGGCACGGTCTCTGTGGCGTGGTTACCGTCGGATACCTGTTTGTGCAGATTATGGGTGGCATACTTGGCAAATACCCGCAGATACTGAATATTTTCAGAATCAAAGTGCGGCTGGCCGATTTGAAGATAGTGCATGCGACATCGGGACTGTTGGCGTATCTTTTGGTCAGCATAACGTTCATGCTGGCGATGTTTAGCACATGGTTTACGTCAAACATAACAGGGACAACATGGTTTGGGTGTTTTGGCTGTATTTCGTGTCTGGCATTGATTGTTATGAATCAAGTGACCACTGCTTATCTTCCCAGTGGGAGACCTGCTAAATAAATACTCAGTGTTCAAATGATTACTTTTTTTTCTAACTTGATTTTTGTGAATATTAAGGTTCAAGTTTGCTATCTTTCAATTAACTGGACTGTCCAGGACAGGGGTTAATAATATTTTGTTGTTTAAGTCAAACGGTAACAGGGACCATGTGTTTTGGGTGTTATTTAGACCCGCTAAATAAATATTCAGTATTCAAATGATTACTTTTATTCTTTTAACTGATTTTTTGTGCATATTAAGTTCGAGTAGGCTATCTTTGGACACACACATTTCAGATAACTGGACTGTCCAGGTCAGGGTTTAATGTTTGGTTATTAATGGTTAGCCAGAGAGAAGATGGGGTAGTGACCGTATACCTCCCCATTCGGATGTTAAAAAACATCACTCTAGGTGAGAGCTGGTATTGGGATGTGAACCCTGTACCATCAGCCTTTAAGGTTGATAGCTTAACCACTACATCAGTGAGGCTGGCAATGATTGCTCACTATTGTCTGGTAGAATGTATCCTTGTGGAGAACTTAACCTGGAGTTTGCTAAATCATGGATTGAATTTTGTCAATACTGACAATAGATTTCATAATAAACTTTCTTAATGCTCATAAAAGAATGAGCATGTTGTACAAGCTTTTATTTTGTATTACTAATTTGTTTAGCTATGAACAATTTATTTGGCTATATATTTGCTTTTTAGTTATATGAGGTTGTATGTTGTTATATTCAGAGATGCACATGCTCCCATTTTTGTAAGGGGGGGAGGCTGGCTTGTTTTTGCCCGAATGAAACTAAAATGCCTGAATTTGAATAACAACATTTATTCATATTAGCATTACTGCCAAATAGCTATATAGGGTTACAAATGAATCATTGAGCATTTTTACATGGATTACAGCTAATTTTGCAGGTAGAATGATGGAAATACATGGTAAAAATGTCTCATATTAGCGCATTGTGCCTGAATATCTCTGTTATATGTGGTTCTTCTAAAGCAAGTTTCAACACTCCTCAGTTGCAGCTCATGTTGATATAATATTTCCTAGCCAATAGCAATTTAGTGGGCGGGGTGAAATGTACCTTGTTTTGCCCTACTGGTAACCATATAAATAAAGTTAAAATCTGTCTTGTGTCCCTACTAAAGACTGTCCCCTCCACTAGAGATTGACCCCCCCTTACTCCAGATATTGTTCCTAGGGGCCTGATGTGGTTTTGAAAATTTCTAGTTAGTGTTTGAACAACTGGCCCTTGATCTATATACTGTAAATTGAATTAATATTGTAACATGTTTAAAAAAAAAAAAATTGCTAGTTAACGAGTAAATTTAGCAAACAACTAACATCACCTTAAGAACCTGCAAAATAGAACTGTGAACTTGAGTTAATTTTTAATGAATGTTTTTATGCATTAATTATTGACATGCTGGGCCATCTGTAGTTGTATACTTTAGATTTCGCTATTTTGGGCATAGCTGGCATTTTGGTTTTTCACAATAATAATACTAACATGTTGAATGGTTGTAGAAATTCAGAAATATTGCAAGTTGTTATTTAAATACAATTAAAGAACAATATTTGATTGGTTTTGAGGTGAAATATTTGAGGTCAGCATGTTTGGGTGTGACATTTATTGGGTACAATATTTGTTGCCATGATTTTGGTGCAGTGTAATGTCCTGTCTTATTAAGTTGTCTTTGTGTTCATATCCACCTATGATGTAAGCATGCTGTCCTGGGCAGACACCTCGACTA

Transcript

ctg1058-0.3-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF03188	Cytochrom_B561	Eukaryotic cytochrome b561	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR006593	Domain	Cytochrome b561/ferric reductase transmembrane	Interproscan
IPR045150	Family	Transmembrane reductase CYB561D1/2	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR15422	OS05G0565100 PROTEIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0016491	Molecular Function	oxidoreductase activity	Interproscan
GO:0020037	Molecular Function	heme binding	Interproscan
GO:0140575	Molecular Function	transmembrane monodehydroascorbate reductase activity	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg1058-0.3-1 global RNA-seq network