Gene detail

Detailed information of ctg328-1.10-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg328-1.10-1	SERINE-THREONINE PROTEIN KINASE	chr3	35251672	35293063	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg328-1.10-1

ATGGAGAACACAGATGATGTAATTCGCTGTCCTGTACACGGAGGAGACGTCTTACTGGCTGAACTGGCCCCAGACATCATGCTTCTTGACGTAGAAGAGAGATTTAGGATGAATGTGGATGAACTTGAATTTAATGCAAGTCCGGAGAACCTGTTGGGTGATGGAGGATTTGGAAGTGTTTACCGTGCCATCTACAAAAATCAGGTTGTTGCAGCAAAGGTGTTCAACCCACTTGGCGATGTCCACCCCCACAAACTGCTACGGCAGGAGGCCACAGTGCTGCGTCGCCTCCAACACCCGAGTGTTATCTCACTTCTTGCCGTCGGCCTGCGACCTTGCAGAATTGTCGTACTCGAATTCGCTTCTCTCGGAACTTTGACTCAGATTTTGAAATCAGAGAAAAATCTGAGCAAGATTGCCGAGGGACTGGAATATCTTCACGCTCTGATGATTGTTTTCCGTGACCTCAAACCAGACAACATCCTCATGTTCAGCTTGTCACCCAGTGATCTGATCAATGCCAAGATATCGGACTATGGAATCTCACAGTTCACCACACTGTATGGTCTGACGGCTCAAGAGGGAACGCCAGCGTACAGGGCACCTGAAGTTATTCGCCGAGAAACCTATTCTTTTCAGGCCGATGTGTTTGCGTTTGGGATTCTGCTGTACATCTTACTCACGGGAGGCTGTCACCCTCACGAGGAACTCAAGTCAAGAAGTGACATGGATCGGGCATTTGCTGATAATTCTCCAATTCAACTGATCACTCAACGTGGAAAACCTCCATGGCCAGACATGCATGATTTGGTGAGGCAGTGTTTGCATCAAATACCAGATGATAGACCCAAGACTGATGAGATTGTGCAGCGACTGCGATCAGCTGAACTGTTTAGTTTGAAACAGTGGTACCCCATTTCAGTCGGGACAACCGTTGAGTGCATGACATACCAGATGTGTGAGAACGACTTGACAAAAGTGTGGGTTGCCAGTGGGAATAACGAACACATGGAGTTGAGTCGGTTAAATCTCCAGACTCACTGTGGCTGTGTGGACCTACAACACAAACTGCAGGCAGCCTGGAAGACGTCCGCCAGTCCAGTTGGTCGTTCTCTAGGTGAAGGTCGCATTCTGAGTATTTTGTCTGTGGACAGTGAGCACGTTCTGCTCGGTACACAGATGGGGAAAATCTCCGTGTTCGACACGGCCAAGTTCGAGGTCATTCACTCGACGATACAGCTGGGCGACTCAGTCATTTCTCTACATCTATGTCCCAGACAAGATGATCCTATGGTCCTAGGAGGCCTAGCAAATGGAGTCCTGGTGTTTTATCCACTGTCAGAACTTCTGCAGAAACCAGTTCATTACCCCCTGTGTTTGAACCTGGGGAGCAAGCACGAGCCCATCAGGTGTATGGTACAAATGAAGAACAAAGTCCTTGCATCATGCGGCACTCGCATCTTCATCCTCAACACCAAACACGGCCTTGCTATTGAGAACATCTGTGACACAGTTGACAATGGTGATATACAGATGGCTGTACCAATCTGCACGATGGCAGCAGGACGTCACATATTCTTGTCTCACATACGATCACCCACGCTGCAAGTGTGGGACATCTACAAACAGCGCAAACACGACGAGTGCAACATTGCACAGCTGTTCAACATTGACAAGAATCAAGCAAGAATCACAGCTATTTTGCTACATGAAAGCCGAGCATTATGGGTAGGAACCGGCGGTGGTCACGTGGTTATCCTGGAATCTGCGACTCTTGCTCCTGTGATTGTTACGTCTCGTCACACCTCAAGTGTTCGTGGTTTAATGTGTATCATACCATCATGTCGTACCGCTACCTCTGTTGTTCTTAGCTGTGGTCTAGGATTCAAAAATGGACATGATGAAACGAAAGATTGTATATTTGTCCGTCCAGGTTCACAATACGGATGTGTTGCAGTGTGGGATGCAGATTTTCCACAGCTAGTAAAGAGTTTCAAAGAAGATGTCAAAAAACGACAGGAATTGGCAAATAGTGTTCCATAATCTTGTTCTTAAAATGAACACACTTGTTAAAACCACACACTCGGGGAACATTTTGTTTTAAAAATCTTGATTAGCAATATTTCTAGTCAACTGAAAATTGATTAGTAACTACTGTGTAATGTTTTAACATTGTGTTGTAAATCACAACGCGATACTGAACAAAATGTTCCCTGACACTGGATCACAATGTGAATGAAATGGATAATACAAATCCATTTATTTTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTCTATATATACACACATGTATATGTTTGACATCCATGAGATGTTCTTTACATGTACATGCACTGTTATTTAATCAAATTAATGGGTAATTAATAATACTCACTACCATTACATATCATGTTTATTCCCTCGTAAAATAAACTACATGACATGTTATCGACATTATGTTTTTGCTGTACGTCGTCATGTTTGTTATGGAGCAGTCTGGTGTTATGAATGTCATCATGTTCATTTTATTATTGATCATTCATTGTTAAATAAATGTGTATTTTGTTCTATGAATCACTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAATACATGATATACCAGTACTGCTATGAATAATCAAGTATACTGCTGTGGATAATTGAGTATCCAGCTATGGATAATTAAGTATCCTGCTATGGATAATTGAGTATACTGCTATGGATAATTAAGTATACTGTTACAGATAATTGAGTATCCTGCTATGAAAAATCAAGTATGGTGCTATGGATAATCAAGTATACTGCTATGGATAATCAAATATCCTGCTATGGATAATCAAGTAGGTGCTGTGTATTTTAATTTAATCTGCAGTCACTCTATATATTAGCAAGAGACATATCTAGATGTACTTTTATCCTAGTTATTGTACGTGTAATCGGCAAAGGAAGGTTGAAATTTGAACCTACAACATAACAATCCAATGTTAAAATATAAAAATAATGAATAACTTTAATATTACAGCAAAATAATGAATAACTTTAATAATAACAAACTAATCAATAACTTTATTTAATACTAGAAAATATATTATTTGAATAAGAACTATTTTATTTTGGTGTATAGATATTCTAGGTAACAAGGTTATATGTCACAAGATAGTCAATAAGCATATACATATATATATATACACACTGTATATACCTACTGGGTACTACTCTATGAAAAGGGTAAAGGTGTAGAATAAAACAATCCTTTTATTGTTTATTTATATAATACTGTTATATTTGTGGACCCATTAGGCTATTTCTCATACCAGCCATTGCTCCATAACTGATGTAACAATTATTTATAATCAAATATAGTGCTACGAATTTTGAAGTATCGTTCTATGGTATACTACAATGGATTATGATGCATACTACTGTGGATCACCATGCATACTGCTATGGATTTTCGTGTATAGTGCTGTGAATTTTAATGTAGAGTGCTATGGATTTTCATGTATAGTGCTATGGATTTTTGTGTATAGTGCTATGGATTTTCATATATAGTGCTATGGATTTTCATGTATAGTGCTATGGATTTTCATATATAGTGCTATGGATTTCCGTGTATAGTGCTATGGATTTTTGTGTATAGTTCTATGGATTTTCATGGATAGTGCTATGGATTTTCATGTATAGTGCTATGGATTTTCATGTATAGTGCTATGGATTACAATTGTGTATCATTATGCAATATATTTTTACATCATGATGTATACTGTTATGGATCGTGCTTAATTACATATAATCATGTGTGTTTCTATGGATCATGTTTAACTGCACATGCATGTATCTCAGCTATCTGTCATTATGTAGTTAAATACTATCATGTATTCTGTTAATTGTGTTTAGTACACCAGGTATACTGATACAGATAACCATATTTTCATGCATATGATATATACTGACATAGGTCACAATCTCTGGGTACATATCATATTTATGGGTTATAAATGTTTTCTTATATAGTAATGTGTATACCAATATGGGTTATAATATTTATTTACTTATCATGCATACTAACACTCATTATGATGTTTTTGTTACATATCATATATATAGAATACTAAACGATCTTGCCTGTCATGCCATTTTTATGAAATGAGCGAAGTGTTGGTATTTGACAAGCAAAATCAATACCAACACTGTTCACGTGTTTCATAAAAATGGTATGACAGGCAAGCTAGTTTAATATTTTATTTATTACAAACCAACTGCAAACAAGCCACAACAACAAAGTAAGCAGATGTCGAGACCTACTACACATTATTTTTCTACGAATTGGGTCAGCAAGTGATCTACGTCACACTAATATTACACTAGTTAGATATTTAGTGATTGTTATGACATGAGCAATATCTTACACGGGTGTGTAATAAATATTGATATTGGTTATGATGTTTTGTTACATATCATAAATACTAATATGGGTTGTCACACATCTTGCTTATAATCTTTATTTACATATTGTGTATTGTTATACAGGTACATGATCATCATATTTATTGTTATTGTTTGGAGAAAAATTATTTGTGAAATAACAGACATCAAAAACAAATTTTATTTTTAATAGTAAATTTACATTTAACCTAAAGCAAATCTCGGTGACTTTACAATTATTTGTTTTTATTCAGTGGAAACCAGTCACATCACATGCAGTGGTCAGTTAACAAAGAAAGAAATGTTTTATTTAACGACGCACTCAACACATTTTATTTACGGTTATATGGCGTCAGACATATGGTCAAGGACCACACAGATTTTGAGAGGAAACCCGCTGTCGCCACTTCATGGGCTACTCTTTACGATTAGCGGCAAGGGATCTTTTATTTGTGCTTCCCACAAGCAGGATAGCACAAACCATGGCCTTTGTTGAACCAGTTATGGATCACTGGTCGGTGCAAGTGGTTTACACCTACCCATTGAGCCTTGCGGAGCACTCACTCAGGGTTTGGAGTCGGTATCTGGATTA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Transcript

ctg328-1.10-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
Ubiquitin Family	UBD\|Other\|Beta-prp

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00069	Pkinase	Protein kinase domain	Domain	Interproscan
PF19056	WD40_2	WD40 repeated domain	Repeat	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000719	Domain	Protein kinase domain	Interproscan
IPR011009	Homologous_superfamily	Protein kinase-like domain superfamily	Interproscan
IPR015943	Homologous_superfamily	WD40/YVTN repeat-like-containing domain superfamily	Interproscan
IPR017441	Binding_site	Protein kinase, ATP binding site	Interproscan
IPR036322	Homologous_superfamily	WD40-repeat-containing domain superfamily	Interproscan
IPR050167	Family	Serine/threonine-protein kinase	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR23257	SERINE-THREONINE PROTEIN KINASE	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0004672	Molecular Function	protein kinase activity	Interproscan
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0005524	Molecular Function	ATP binding	Interproscan
GO:0005737	Cellular Component	cytoplasm	Interproscan
GO:0006468	Biological Process	protein phosphorylation	Interproscan
GO:0007165	Biological Process	signal transduction	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg328-1.10-1 global RNA-seq network